確かに無茶苦茶遅い
CPUやメモリの問題よりはHDDやファイルシステム的な問題が強そうなり～
ウィルスチェックが動いていたりファイル書き込み毎にインデックス再構築とかしていません？

うるさいのがHDDなら箱にしまっちゃいましょう
http://www.platon.co.jp/~take6/silent_pc/smartdrive.htm

CPUファンは大型低速回転のモノにするといい感じです
http://www.scythe.co.jp/cooler/20040713-193830.html
こんなのとか

自走式ファンと呼ばれるアレを搭載したPCを部屋に置いていた自分にとっては並の騒音はどうってこと無いですけどね。

コメントテスト

新サーバに変えるとコメントを書き込むのが異様に遅くなったような感じがします。
MovableTypeって低スペックPCには厳しいんですかね。